而另一方面，各省市大多出台有文化引导资金，用于奖励动漫企业制作原创动画。但资金监管不佳，导致个别公司利用播出漏洞骗钱。动画成本的高低完全取决于制作的精良程度。劣质的动画片免费送去电视台播映，一来电视台可以减少支出成本，二来劣质动画片可以凭省市级播出补贴赚钱，长此以往，劣币驱逐良币。

当然这也把“管理问题”提上议程，不仅是对资金的管理，还包括对丛生的产业基地的管理。不过，面对监管部门的是另一重尴尬。

2008年7月，国务院办公厅针对动漫游戏产业三个主要管理部门相互“打架”的问题出台了《“三定”规定》：文化部成为了动漫游戏产业的主管部门；国家广播电影电视总局负责对影视动漫和网络视听中的动漫节目进行管理；国家新闻出版总署负责在出版环节对动漫进行管理，对游戏出版物的网上出版发行进行前置审批。

但是诸多产业基地的颁牌已然发生，虽然目前文化部是主管部门，但文化部的指令是否执行得下去也是一个问题。

北京电影学院动画学院院长孙立军表示，这是国家机构改革需要解决的问题，不过解决之道还是取决于部委是否真心想要合作。